Flagellata seu Mastigophora (e Graeco mastigos, flagellum et phorein, ferre) sunt Eucaryota unicellularia flagello praedita. Olim Protistorum phylum creatum est Flagellata continens, sed analyses phylogeneticae monstraverunt taxon polyphyleticum esse, id est phylum clados multos comprehendisse non omnes propinquos.

Hodie flagellatorum phylogenesis non diligenter cognoscitur, itaque greges (regna aut phyla) sedem continuo mutant inter Eucaryota:

Nexus interni